Cholera Spread afkomstig uit de Baai van Bengalen

Om de bron te traceren en de verspreiding van de nieuwste (zevende) cholerapandemie te verklaren, werd de sequentiebepaling van de volgende generatie door onderzoekers gebruikt. Ze benadrukten ook de impact van de verwerving van antibioticaresistentie op het ontstaan ??van uitbraken en resistentie vertonen werd voor het eerst verkregen rond het jaar 1982.
Het specifieke cholera-type dat verantwoordelijk is voor de huidige pandemie kan worden teruggevoerd tot een voorouder die 40 jaar geleden voor het eerst in de Golf van Bengalen verscheen, de sequentiebepaling van het volledige genoom onthulde. Cholera heeft zich in meerdere golven van deze voorouder keer op keer verspreid naar verschillende delen van de wereld.
Deze ontdekkingen verschaffen een beter begrip van de mechanismen achter de verspreiding van cholera, een diarree-infectie die normaal verbonden is met onhygiënische omstandigheden en slechte sanitaire systemen en vaak worden aangetroffen in rampgebieden, zoals de aardbeving in Haïti in oktober 2010. Cholera heeft naar schatting invloed op 3-5 miljoen mensen per jaar, met 100.000 tot 120.000 doden.
Door het analyseren van de genomen van de veroorzakende bacterie Vibrio cholerae, afkomstig van 154 patiënten wereldwijd gedurende de afgelopen 40 jaar, volgde het team de verspreiding van het organisme. Met het vermogen om individuele DNA-veranderingen in het genoom van deze stam te volgen, konden de onderzoekers de transmissieroutes van de bacteriën in kaart brengen, toekomstige zorgplanning helpen en het terughalen van de ziekte naar de oorsprong mogelijk maken.
De huidige bacteriestam (El Tor-stam) werd in 1982 voor het eerst resistent tegen antibiotica door het verwerven van de genetische regio SXT, die in die tijd de bacterie binnendrong en die een hernieuwde wereldwijde transmissie uit de oorspronkelijke bron genereerde, ontdekten onderzoekers.
Dr Julian Parkhill, een senior groepsleider bij het Wellcome Trust Sanger Institute en een senior auteur van de studie legde uit:

"Door de genomen van 154 gevallen van cholera te vergelijken, hebben we belangrijke ontdekkingen gedaan over hoe de pandemie zich heeft ontwikkeld.
Ons onderzoek toont het belang aan van globale transmissiegebeurtenissen in de verspreiding van cholera. Dit druist in tegen eerdere overtuigingen dat cholera altijd voortkomt uit lokale stammen en biedt nuttige informatie voor het begrijpen van cholera-uitbraken. "

De oorsprong van de pandemische stam werd, door het onderzoek, in de Golf van Bengalen vier decennia geleden cruciaal geïdentificeerd. Sindsdien heeft het wereldwijd personen besmet, waaronder Afrika, Zuid-Azië en Zuid-Amerika. Nicholas Thomson van het Sanger Institute en een van de eerste auteurs van het onderzoek, zei:

"kijkend naar de afgelopen 40 jaar van uitzendingen van continent naar continent, ontdekten we dat de Baai van Bengalen fungeert als een reservoir voor cholera, waar het kan gedijen en zich kan verspreiden.
Door te volgen hoe de ziekte wordt verspreid, kunnen onze kaarten van transmissie toekomstige beslissingen over de aanpak van deze ziekte beïnvloeden. "

Ankur Mutreja, de eerste auteur van het Sanger Institute, legt uit dat deze ontdekkingen nieuwe manieren openen voor onderzoekers die alle gebieden van bacteriële infecties onderzoeken: van onderzoeken hoe genetische veranderingen stammen in staat stellen om resistentie tegen antibiotica op te bouwen, om een ??ziektetransmissie te volgen en traceer het terug naar zijn wortels. Deze primaire bevindingen kunnen de sleutel zijn tot het ontsluiten van verschillende andere bacteriële pandemieën.
Professor G Balakrish Nair, directeur van het National Institute of Cholera and Enteric Diseases in Kolkata, India zegt:

"Dit is een van de eerste onderzoeken die evolutionaire gegevens combineert met de opkomst van hedendaagse nieuwe varianten van Vibrio cholerae en vervolgens de fylogenetische kenmerken gebruikt om de intercontinentale verspreiding van cholera te volgen.
Deze ontdekkingen zullen ons te zijner tijd leiden om te begrijpen waarom cholera-pandemieën in Zuidoost-Azië beginnen en zich vervolgens als een golf over de hele wereld verspreiden. "

Geschreven door Grace Rattue