Dodelijk nieuw virus ontdekt in Afrika

Een stuk genetisch detectivewerk door een internationaal team heeft een dodelijk virus ontdekt dat niet eerder werd gezien en dat waarschijnlijk in de zomer van 2009 een kleine geïsoleerde uitbraak van acute hemorragische koorts veroorzaakte in Centraal-Afrika.
De uitbraak, in de Democratische Republiek Congo (DRC), heeft twee mensen gedood en één persoon ernstig ziek achtergelaten. De onderzoekers hebben de dodelijke ziekteverwekker de naam Bas-Congo-virus (BASV) gegeven, naar de provincie waar de drie mensen woonden.
Ze rapporteren hun werk in het 27 september nummer van het online open access tijdschrift PLoS Pathogenen.
De onderzoekers bevonden zich in een internationaal consortium bestaande uit de Universiteit van Californië, San Francisco (UCSF), het Amerikaanse bedrijf Microbiota en andere instellingen en organisaties in Amerika en Afrika.

De uitbraak van 2009

De uitbraak van acute hemorragische koorts in 2009 begon toen een 15-jarige jongen uit een dorp genaamd Mangala in de DCR plotseling ziek werd en begon te bloeden uit de neus en het tandvlees en bloed braakte. Hij werd erg snel slechter en stierf drie dagen later.
Een week later begon een 13-jarig meisje dat naar dezelfde school ging als de jongen, met dezelfde symptomen, die ook snel verslechterden, en ze stierf ook binnen drie dagen.
Toen, nogmaals, nog een week nadat het meisje was overleden, begon een verpleger die voor haar had gezorgd met dezelfde symptomen. Hij werd overgebracht naar het ziekenhuis en overleefde.
De UCSF-teamleider was Charles Chiu, universitair docent laboratoriumgeneeskunde aan het UCSF en directeur van het Abbott Viral Diagnostics and Discovery Center van de universiteit. Hij zegt in een persbericht:
"Dit zijn de enige drie gevallen waarvan bekend is dat ze zich hebben voorgedaan, hoewel er in de toekomst nog meer uitbraken van dit virus kunnen zijn."

Deep Sequencing onthult BASV

Eerste tests voor bekende virussen op bloedmonsters van de overlevende onthulden niets. Maar uiteindelijk, nadat meer leden van het consortium waren betrokken, hebben verdere genetische tests een volledig nieuw virus ontdekt.
Deze tests gebruikten een nieuwe benadering, "deep sequencing" genaamd, die miljoenen reeksen DNA uit een klinisch monster genereert en ze vervolgens samenvoegt met behulp van computeralgoritmen en menselijke analyse.

Chiu zegt dat het nieuwe virus, BASV, heel anders is dan andere virussen in Afrika waarvan bekend is dat het dodelijke uitbraken van acute hemorragische koorts zijn, zoals Ebola-virus, Lassa-virus en Crimean-Congo Hemorrhagic Fever-virus.

BASV is meer als hondsdolheid

Genetisch gezien heeft BASV meer gelijkenis met rabiësvirussen, die een ander type infectie veroorzaken, een neurologische ziekte die maanden kan duren om te ontwikkelen maar die steevast doodt, legt Chiu uit.
Het virus behoort, net als hondsdolheid, tot een familie die de rhabdovirussen wordt genoemd.
"BASV was aanwezig in het bloed van de eenzame overlevende in een concentratie van meer dan een miljoen exemplaren per milliliter. Het genoom van BASV, samengesteld uit meer dan 140 miljoen sequentielezingen, onthult dat het heel anders is dan elk ander rhabdovirus," schrijven de auteurs .
Er is geen ander rhabdovirus bekend dat de acute, snelle en dodelijke hemorragische koorts veroorzaakt in de drie gevallen in Congo. Hondsdolheid kan bijvoorbeeld dodelijk zijn als het niet wordt behandeld, maar het ontwikkelt zich niet op de snelle en dodelijke manier die wordt gezien met BASV.
Er is echter een precedent: bij vissen, waarvan bekend is dat rhabdovirussen hemorragische septikemie veroorzaken (acuut bloeden en overlijden).

Reservoir Onbekend: meer werk te doen

Toen de onderzoekers een antilichaamtest deden met de man die het overleefde, en degenen die met hem in contact waren gekomen, concludeerden ze dat terwijl het virus zich van persoon tot persoon kan verspreiden, de waarschijnlijke bron niet in de mens zit, maar in een andere soort, zoals een insect of knaagdier. Het waarschijnlijke "reservoir" en de verspreiding van het virus wordt nog steeds gezocht.
Chiu's team werkt nog steeds aan nieuwe manieren om het nieuwe virus te diagnosticeren, zodat gezondheidsfunctionarissen in Centraal-Afrika het snel kunnen identificeren als er een nieuwe uitbraak is.
Joseph Fair, co-auteur en vice-president van Metabiota, zegt:
"Bekende virussen, zoals Ebola, HIV en influenza, vormen slechts het topje van de microbiële ijsberg."
"Het identificeren van dodelijk onbekende virussen, zoals het Bas-Congo-virus, geeft ons een voorsprong bij het beheersen van toekomstige uitbraken," voegt hij eraan toe.
Geschreven door Catharine Paddock PhD