DNA Barcoding biedt een snelle, goedkope en gemakkelijke manier om soorten te identificeren, fraude te ontdekken

Aangezien de DNA-technologie voor barcodes sneller, goedkoper en gemakkelijker te ontwikkelen wordt, breidt deze zich snel uit naar veel gebieden, van het ontdekken van fraude zoals verkeerd gelabelde vis en niet-vermelde ingrediënten in kwakzalverdelmiddelen, tot het onthullen van oude levensvormen die bevroren waren in de Arctische permafrost, en het voorkomen van ongewenste land- en bosbouwinsecten die de grens overschrijden.
Zulke toepassingen, en vele andere in wat wordt beschreven als een wereldwijde explosie in het gebruik van DNA-barcodes, waarbij de kleinste tot de grootste soort kan worden geïdentificeerd aan de hand van een DNA-fragment, zal centraal staan ??wanneer 450 experts ter wereld samenkomen voor de vierde Internationale Barcode of Life-conferentie aan de universiteit van Adelaide in Australië van maandag 28 november tot zaterdag 3 december. De organisator van de conferentie is David Schindel, uitvoerend secretaris van het Consortium voor de Barcode of Life (CBOL). Hij is gevestigd in het Smithsonian Institution, Washington, DC.
DNA-barcoderingstechnologie bereikte de krantenkoppen en veroorzaakte Congressionele hoorzittingen in de VS toen het werd gebruikt om wijdverbreide "visfraude" te ontmaskeren, waarbij goedkope vis werd bestempeld als duurdere tonijn, snapper en andere soorten. En andere studies hebben ook gemeld dat DNA-barcodes hielp bij het identificeren van niet-vermelde ingrediënten in kruidentheebuiltjes.
Andere interessante nieuwe toepassingen die naar verwachting tijdens de conferentie zullen worden besproken, zijn:

Onthullende vervangende ingrediënten in "kwakzalverij" kruidengeneesmiddelen

Bijvoorbeeld een rapport merkt op dat DNA-barcodes hielp om te ontdekken hoe een Maleisische fraudeur rubberboomhout behandelde met kinine om het een bittere smaak te geven die lijkt op Eurycoma longifolia, een traditioneel medicijn tegen malaria, diabetes en andere ziekten.
Onderzoeker Muhammad Sharir Abdul Rahman zegt dat ze een "eenstapsdetectiekit" ontwikkelen die snel de DNA-barcode kan scannen van een bibliotheek van de 1200 Maleisische plantensoorten met potentiële medicinale waarde, waaronder ginseng. Er worden ook DNA-barcodebibliotheken ontwikkeld voor medicinale planten in andere landen, zoals Nigeria, India en Zuid-Afrika.

Identificatie van oude permafrost-levensvormen

Van wolachtige neushoorns tot paddenstoelen en planten, we beginnen te ontdekken welke organismen groot en klein in de oude Arctische omgeving leefden.

Wetenschappers analyseren cilinders van sedimenten bevroren 10.000 tot honderdduizenden jaren geleden en gebruiken DNA-barcodes om distributies van vroegere dier- en schimmelsoorten te identificeren. Dergelijke informatie helpt ons ook om meer te leren over wat de klimaatverandering beïnvloedt.
Universiteit van Oslo-gebaseerde onderzoeker Eva Bellemain, vertelde de pers:
DNA is een taaie molecule "die" gedurende tienduizenden jaren in de bodem kan blijven hangen en relatief intact blijft ".

Wie eet wat? Wilde kamelen in Australië

DNA-barcoding kan zelfs soorten onderscheiden die voorkomen in de darm en de mest van dieren. Hugh Cross, een onderzoeker aan de universiteit van Adelaide, gebruikt de technologie om een ??gedetailleerd onderzoek uit te voeren naar het dieet van de snelgroeiende Australische populatie van wilde kamelen, waarvan men denkt dat die nu een miljoen is en een aanzienlijke en mogelijk ernstige vorm zal aannemen. impact op de ecologie van het land.
De in de 19e eeuw geïntroduceerde wilde kamelen, afstammelingen van roedeldieren, eten ongeveer 80% van de plantensoorten die ze tegenkomen.
Schindel vertelde de pers dat:
"Biologen zaten te wachten om te leren hoe voedselwebben in de natuur werken en wat er gebeurt als ze in elkaar storten.Nu kunnen ze maaginhoud en mestmonsters verwerken om binnen een paar uur een compleet beeld te krijgen".

Het stoppen van invasief ongedierte van het overschrijden van grenzen

Tot voor kort was het proberen en stoppen van ziektedragende insecten en invasieve soorten om een ??land binnen te komen een beetje een schot in de roos, maar DNA-barcodes bieden een manier om bijna onmiddellijk antwoorden te krijgen, zodat invoer kan worden geaccepteerd of afgewezen.
Met behulp van fondsen van de Europese Unie heeft een consortium van 20 academische centra en andere organisaties het QBoL-project (Quarantine Barcode of Life, www.qbol.org) gevormd dat een bibliotheek met DNA-barcodes ontwikkelt, zodat de autoriteiten snel kunnen identificeren de meer algemene invasieve organismen en stop ze het land binnen te komen. De bibliotheek bevat DNA-barcodes voor bacteriën, schimmels, fruitvliegen, nematoden, virussen, planten en andere soorten.
DNA-barcodes zullen ook helpen de handel in hout dat is geproduceerd door het kappen van met uitsterven bedreigde boomsoorten te verminderen.
Dit zijn slechts enkele van de honderden onderwerpen die in Adelaide zullen worden besproken, waaronder ook: het identificeren van de soort en prooi van de Afrikaanse tseetseevlieg en andere ziektedragende insecten van DNA-barcodes van hun maaginhoud; het beoordelen van de wereldwijde status van bijen en andere bestuivers; barcoding soorten van de handel in siervissen; beoordeling van de waterkwaliteit; en het identificeren van binnenschimmels die gezondheidsproblemen bij de mens veroorzaken.

Schindel zei:
"Net als Google en Wikipedia bestond DNA-barcoding nauwelijks tien jaar geleden en nu zijn we een levendige community, gebouwd op wetenschappelijke tools van de 21e eeuw."
"DNA-barcoding is de uitdrukkelijke manier om veel van de mysteries van de natuur op te lossen die relevant zijn voor een spectrum van nationale belangen," voegde hij eraan toe.
Een voorbeeld van hoe snel dit veld groeit, is dat in 2005 de University of Guelph in Canada 33.000 records over 12.700 soorten huisvestte in de Barcode of Life Data Systems (BOLD). Het huisvest nu zo'n 1,4 miljoen records met ongeveer 167.000 bekende en voorlopige soorten: een 40-voudige toename in 6 jaar.
Klik hier voor meer informatie over de conferentie en om de agenda te bekijken.
Geschreven door Catharine Paddock PhD