nl.3b-international.com
Informatie Over Gezondheid, Ziekte En Behandeling.



DNA-sequencingtechniek met behulp van ontwikkelde halfgeleiders - lage kosten, draagbaar en schaalbaar

Wetenschappers van Ion Torrent Systems Inc. hebben een DNA-sequentietechniek ontwikkeld met behulp van halfgeleiders in plaats van de dure en complexe optische technologie. Ze zeggen dat hun apparaat veel lagere kosten heeft, het is draagbaar en kan worden geüpgraded (schaalbaar). Hun doel is om de richtprijs van $ 1.000 te bereiken voor een genoomsequencing.
Oprichter van het bedrijf, Dr. Jonathan Rothberg, de uitvinder en het team van de machine, schreef in het tijdschrift Natuur deze week:

"Het rudimentaire belang van DNA-sequencing voor de biowetenschappen, biotechnologie en geneeskunde heeft de zoektocht naar meer schaalbare en goedkopere oplossingen gedreven."

Het bedrijf beweert dat hun apparaat een breed scala aan DNA-sequenties heeft, van microben tot mensen.
Het apparaat, door het bedrijf aangeduid als een PGM (Personal Genome Machine), gebruikt een massaal parallelle reeks van halfgeleidersensoren die de tijdens de DNA-replicatie geproduceerde waterstofionen meten. Dit gebeurt in realtime. Eenvoudiger gezegd, de machine heeft een siliciumchip met 1,2 miljoen sensoren die bestaan ??uit kleine putjes - deze zijn gevuld met kralen die DNA-strengen bevatten waarvan de sequentie moet worden bepaald. De put heeft detectoren die de waterstofionen meten die tijdens DNA-replicatie worden geproduceerd. De DNA-sequentiebepaling kan binnen ongeveer twee uur worden voltooid, in plaats van weken.
Ion Torrent Systems 'vice-president marketing en bedrijfsontwikkeling, Maneesh Jain, zei de volgorde van E coli in Duitsland en China tijdens recente uitbraken werden geïdentificeerd tijdens de eerste drie dagen met behulp van PGM's, in plaats van enkele weken. Dit gaf gezondheidsautoriteiten waardevolle tijd om er iets aan te doen.
Jain voegde toe dat de PGM van het bedrijf wordt gebruikt in laboratoria over de hele wereld, in meer dan 40 landen.
Dr. Jonathan Rothberg zegt dat hun machine werd gebruikt om het genoom van medeoprichter van Intel, Gordon Moore, te decoderen.
Dr. Rothberg zei:
"Gordon Moore bedacht alle trucs die ons moderne halfgeleiders gaven, dus hij zou de eerste persoon moeten zijn waarvan de sequentie wordt bepaald op een halfgeleider."

Het DNA-coderingsapparaat verkoopt voor $ 49.000 dollar, aanzienlijk minder dan zijn huidige rivalen.
Verschillende bedrijven concurreren om het prijskaartje van $ 1.000 voor het sequencen van een menselijk genoom te halen, volgens de prijsdeskundigen zou dit de weg kunnen banen voor routinematige sequencing in de medische praktijk. Ion Torrent Systems denkt dat ze het doel van $ 1.000 tegen 2013 zullen bereiken.

De wetenschappers schreven in Natuur dat:
"(Dr. Moore's genetische variant duidt op a) 56% kans op bruine ogen ... typische hoeveelheid sproeten ... matig hogere odds van ruikende asperges in de urine."

De auteurs voegde daaraan toe dat, verrassend genoeg, het genoom van Dr. Moore een hoger risico op mentale retardatie aangeeft. Natuurlijk bleek de man zeer intelligent te zijn, waardoor men zich afvroeg hoe nuttig deze genomische gegevens zijn.
Dr. Rothberg benadrukte dat we op zijn minst een decennium verwijderd zijn van een goed begrip van het menselijk genoom; op een manier die heel nuttig zou kunnen zijn. Het nieuwe apparaat is echter nuttig bij het focussen op een selectie van genen, zoals mogelijk het geval is bij het onderzoeken van kanker.
DNA-sequentie is de exacte ordening van de basen - A (adenine), T (thymine), G (guanine), C (cytosine) - in een DNA-molecule. DNA sequentie verwijst naar het identificeren van de exacte volgorde van de basenparen in een segment van DNA.
"Een geïntegreerd halfgeleiderapparaat dat niet-optische genoomsequencing mogelijk maakt"
Jonathan M. Rothberg, Wolfgang Hinz, Todd M. Rearick, Jonathan Schultz, William Mileski, Mel Davey, John H. Leamon, Kim Johnson, Mark J. Milgrew, Matthew Edwards, Jeremy Hoon, Jan F. Simons, David Marran, Jason W. Myers, John F. Davidson, Annika Branting, John R. Nobile, Bernard P. Puc, David Light, Travis A. Clark, Martin Huber, Jeffrey T. Branciforte, Isaac B. Stoner, Simon E. Cawley, Michael Lyons et al.
Natuur 475, 348-352 (21 juli 2011) doi: 10.1038 / nature10242
Geschreven door Christian Nordqvist

Gefractioneerd Gemtuzumab Ozogamicin-doseringsschema verbetert de resultaten voor sommige leukemie-patiënten

Gefractioneerd Gemtuzumab Ozogamicin-doseringsschema verbetert de resultaten voor sommige leukemie-patiënten

Een Franse studie gepubliceerd Online First in The Lancet heeft onthuld dat fractionering van de dosering van het doelgerichte medicijn tegen kanker gemtuzumab ozogamicine zorgt voor een veiliger aflevering van het medicijn bij patiënten in de leeftijd van 50 tot 70 jaar met acute myeloïde leukemie (AML) en hun uitkomsten.

(Health)

Zeldzame genetische immuunziekte onderzocht met XLP2

Zeldzame genetische immuunziekte onderzocht met XLP2

Onderzoekers hebben een belangrijke stap gezet in het begrijpen van een zeldzame genetische immuunziekte die mannelijke kinderen treft. Met behulp van biochemische analyses kon het team in kaart brengen hoe het XIAP-eiwit een vitaal onderdeel van het immuunsysteem activeert, met name de component die bacteriële infecties in het maagdarmkanaal bestrijdt.

(Health)