nl.3b-international.com
Google Algorithm vindt Kankermicomarkers
Zeven eiwitten die artsen kunnen helpen evalueren hoe agressief de kanker van een patiënt is en of ze al dan niet chemotherapie moeten krijgen, zijn geïdentificeerd door Duitse onderzoekers.
Met behulp van een strategie vergelijkbaar met Google's PageRank-algoritme, konden de onderzoekers van de Technische Universiteit van Dresden, Duitsland, ongeveer 20.000 eiwitten rangschikken op basis van hun genetische relevantie voor de progressie van pancreaskanker. Het onderzoek is gepubliceerd in PLoS Computational Biology.
Het team gebruikte hun eigen versie van het Google-algoritme om nieuwe biomarkers te identificeren, dit zijn moleculen die worden geproduceerd door kankercellen. Hoewel biomarkers artsen kunnen helpen om kanker eerder te detecteren, zijn ze vaak moeilijk te vinden en tijdrovend. Bovendien overlappen biomarkers die in verschillende onderzoeken voor dezelfde soorten kanker worden aangetroffen elkaar bijna nooit.
Het team kon dit probleem echter voorkomen door de Google-strategie te gebruiken. De onderzoekers maakten gebruik van het feit dat eiwitten in een cel via een netwerk van fysieke en regelgevende interacties met elkaar verbonden zijn; de 'eiwit-Facebook' zogezegd.
Christof Winter legt uit:
"Nadat we de netwerkinformatie in onze analyse hadden toegevoegd, werden onze biomarkers reproduceerbaarder."
Met behulp van het Google-algoritme en deze netwerkinformatie vonden de onderzoekers een aanzienlijke overlap met een eerdere studie van de University of North Carolina. In deze overlap konden de onderzoekers een eiwit identificeren dat agressiviteit bij alvleesklierkanker kan evalueren.
Voordat deze nieuwe biomarkers in de klinische praktijk kunnen worden gebruikt, moeten ze worden gevalideerd in een grotere vervolgstudie. Er blijft echter een probleem bestaan: hoe deze inzichten om te zetten in nieuwe medicijnen die de progressie van kanker vertragen. Een klinisch onderzoek naar een alvleesklierkankergeneesmiddel wordt momenteel uitgevoerd door het team samen met het in Dresden gevestigde biotechbedrijf RESprotect.
Geschreven door Grace Rattue
Nanodeeltjes Stop multiple sclerose bij muizen
Een baanbrekende nieuwe experimentele behandeling waarbij nanodeeltjes worden gebruikt die bedekt zijn met eiwitten om het immuunsysteem te misleiden, die erin is geslaagd het stoppen van myeline te stoppen en de voortgang van de ziekte te stoppen bij muizen met relapsing-remitting multiple sclerose (MS). De onderzoekers zeggen dat de aanpak ook van toepassing kan zijn op andere auto-immuunziekten zoals astma en type 1 diabetes.
Genetica voorspellen rookverslaving
Recentelijk is aangetoond dat het genetisch nicotinemetabolisme de neiging heeft om een ??roker te worden. In een nieuwe studie uitgevoerd door het Montreal Neurological Institute and Hospital, The Neuro, McGill University, laten bevindingen zien dat mensen met een snel nicotinemetabolisme een grotere reactie op de hersenen hebben op het roken van signalen dan mensen met een langzaam nicotinemetabolisme.
