Enorme kanker van de kindertijd DNA-catalogus vrijgegeven

Door een enorme catalogus met volledige DNA-gegevens over kinderkanker aan de wereldwijde wetenschappelijke gemeenschap te publiceren, hoopt een team van het St Jude Children's Research Hospital in Memphis, Tennessee, VS de voortgang te versnellen bij het vinden van oorzaken en nieuwe behandelingen voor kanker en andere ziekten.
De catalogus bevat volledige genoomsequenties, in wezen complete DNA-kaarten, van 260 kinderkankerpatiënten. Er zijn in totaal 520 sequenties, die overeenkomen met sets van normale en tumorweefselmonsters.
De wetenschappers die de gegevens vrijgeven werken aan het Washington University Pediatric Cancer Genome Project, waarvan naar verwachting tegen het einde van dit jaar meer dan 1.200 genomen zullen worden genomen.
De release, die wordt beschouwd als de grootste ooit in zijn soort voor de wetenschappelijke gemeenschap, is aangekondigd als onderdeel van een Perspective-artikel dat is gepubliceerd in Natuurgenetica op dinsdag.
Om maximale nauwkeurigheid van de gegevens te garanderen, wordt elk monster 30 keer gesequenced.
De informatie is niet alleen waardevol voor onderzoekers op het gebied van kanker, maar ook voor wetenschappers die allerlei ziekten onderzoeken.
Onderzoekers van St Jude willen de verschillen tussen de genomen van gezonde en kankercellen opsporen om de oorzaken van meer dan een dozijn dodelijke kinderkankers te identificeren.
Hun werk heeft al verschillende belangrijke ontdekkingen opgeleverd, waarover ze in vooraanstaande wetenschappelijke tijdschriften hebben geschreven.
Sommige van deze ontdekkingen bevatten belangrijke inzichten in agressieve jeugdkanker van het netvlies, hersenstam en bloed. Tijdens het onderzoeken van wat er achter de snelle ontwikkeling van het oogtumor retinoblastoom ligt, identificeerden projectonderzoekers bijvoorbeeld een nieuw veelbelovend antikankermiddel.
In een ander deel van het project ontdekten wetenschappers die een dodelijke kinderleukemie bestudeerden, ETP-ALL (een afkorting van vroege T-precursor acute lymfoblastische leukemie), enkele onverwachte genoomverschillen die de diagnose en behandeling van kinderen met de ziekte zouden kunnen verbeteren.
James Downing is een St Jude wetenschappelijk directeur en leider van het project in St Jude. Hij vertelde de pers deze bevindingen, en anderen zouden niet mogelijk zijn geweest zonder het Pediatric Cancer Genome Project, en:
"Door de informatie te delen ... hopen we dat andere onderzoekers deze rijke bron kunnen gebruiken voor inzicht in vele andere soorten ziekten bij kinderen en volwassenen," zei hij.
Het Pediatric Cancer Genome Project is anders omdat het, in tegenstelling tot veel andere genoomprojecten, hele genoomgegevensreeksen produceert, die volledige DNA-sequenties laten zien, in plaats van zich te concentreren op individuele genen.
Dergelijke datasets geven een veel rijker, compleet beeld van de DNA-veranderingen achter de oorzaken en de progressie van de ziekte.
Richard K Wilson, directeur van The Genome Institute aan de Washington University School of Medicine in St. Louis, zei met deze aanpak dat ze een aantal ongewone, "cryptische" veranderingen hebben gevonden in de kankercellen van veel patiënten die ze anders niet zouden hebben gevonden.
Het project heeft ook aangetoond dat er enkele opvallende verschillen zijn tussen kanker bij kinderen en volwassenen, wat onderstreept waarom het belangrijk is om voor elk een afzonderlijke behandeling te ontwikkelen.
Onderzoekers kunnen online toegang krijgen tot de gegevens door een verzoek in te dienen bij het European Genome-Phenome Archive.
Geschreven door Catharine Paddock PhD

Geen BPA-verbod op blikjes en voedselverpakking, aldus FDA

Bisfenol A, ook bekend als BPA, wordt niet verbannen uit blikjes en andere verpakkingen voor voedsel / dranken, de Food and Drug Administration (FDA) kondigde gisteren aan dat degenen die het verbod hadden aangevraagd niet voldoende dwingende gegevens hadden verstrekt. De meest geschikte manier van handelen, zo voegde het Agentschap toe, is dat de huidige onderzoeken moeten worden voortgezet, inclusief enkele federaal gefinancierde onderzoeken, en dat zij hun bevindingen op een later tijdstip zullen herzien.

(Health)

Nieuwe mechanische klodderverwijderaar zeer effectief bij beroerte

Een nieuwe generatie tool die de bloedsomloop herstelt en mechanisch stolsels verwijdert uit geblokkeerde bloedvaten bij mensen die een acute ischemische beroerte hebben gehad, presteerde dramatisch beter in een klinisch onderzoek dan de standaardbehandeling, volgens een nieuwe studie die deze week in The Lancet werd gerapporteerd. Een beroerte, waar de bloedtoevoer naar de hersenen wordt beperkt, is de vierde belangrijkste doodsoorzaak in de Verenigde Staten en is ook een veel voorkomende oorzaak van langdurige invaliditeit.

(Health)