Virussen wereldwijd gestreden door darmbacteriën

De menselijke darm is een uitgebreid ecosysteem van microben en speelt een vitale rol in het welzijn van het lichaam en de verdediging tegen ziekten, omdat de darmflora voortdurend aanvallen van virussen moet bestrijden. Een studie online in Genoomonderzoek rapporteert dat onderzoekers een gemeenschappelijke reeks virussen hebben geïdentificeerd die gekoppeld zijn aan darmmicrobiota bij individuen over de hele wereld toen zij het bacteriële immuunsysteem analyseerden.
Fagen, d.w.z. virussen die van bacteriën leven, vertegenwoordigen een constante bedreiging voor de gezondheid van bacteriële gemeenschappen met virussen die meer dan tien voor één in veel ecologische systemen de bacteriële cellen overtreffen. Gezien het aantal bacteriën in de darm van de mens, ontdekten wetenschappers ook een hoge prevalentie van fagen, die de vraag opriepen hoe virussen kunnen worden geïdentificeerd die zich richten op de darmflora, en wat het verschil is in virale gemeenschappen tussen individuen en wereldbevolking, evenals wat kan hieruit worden geleerd met betrekking tot de menselijke gezondheid en ziekte?

Israëlische onderzoekers besloten gecodeerde informatie van een bacterieel immuunsysteem te gebruiken om deze vragen te beantwoorden. Ze ontdekten een proces dat vergelijkbaar is met de manier waarop antilichamen worden gebruikt door het menselijke immuunsysteem, dat wil zeggen dat bacteriën 'kleine stukjes DNA' stelen van de aanvallende fagen, die worden opgeslagen in de bacteriële genoom CRISPR-loci (geclusterd regelmatig met een kleine tussenafstand) palindrome herhalingen) en vervolgens gebruikt om de aanvaller te identificeren en erop te reageren.
Senior auteur, Rotem Sorek van het Weizmann Institute of Science zei:

"In ons onderzoek zochten we naar gestolen DNA-stukjes van fagen die werden gedragen door bacteriën die in de darm van de mens leefden, en vervolgens gebruikten we deze stukjes om DNA van fagen te identificeren dat naast de bacteriën in de darmen bestond."

Het team paste deze methode toe om fagen in de darmflora van Europese individuen te identificeren en te evalueren, en ontdekte dat bijna 80% van de fagen wordt gedeeld door twee of meer individuen. Vervolgens vergeleken ze hun gegevens met monsters die ze eerder van Amerikaanse en Japanse individuen namen en tot hun verrassing ontdekten ze ook fagen die in hun Europese dataset voorkomen.

Volgens Sorek betekent dit dat de darmmicrobiota van mensen herhaaldelijk zijn geïnfecteerd met honderden soorten virussen. "Deze virussen kunnen sommige van onze darmbacteriën doden, het is daarom waarschijnlijk dat deze virussen de menselijke gezondheid kunnen beïnvloeden," zei hij.
De onderzoekers benadrukken dat het van cruciaal belang is om een ??beter begrip te krijgen van de hoeveelheid druk die wordt uitgeoefend op de 'goede' bacteriën, wat cruciaal is om gezond te blijven, omdat het bewijs voor de gunstige rol van de bacteriën in de gezonde menselijke darm toeneemt . Ze verklaren: "Onze ontdekking van een groot aantal fagen die deze goede bacteriën in onze darmen aanvallen, opent een venster om te begrijpen hoe ze de menselijke gezondheid beïnvloeden."
Wetenschappers zijn nu in staat om te onderzoeken hoe faagfuncties in het darmkanaal na verloop van tijd veranderen en welke impact dit kan hebben op ziekten zoals inflammatoire darmaandoeningen, evenals het vinden van meer effectieve methoden om deze ziekten te behandelen.
Geschreven door Petra Rattue