Detecting Down Syndrome Risk - Niet-invasieve methode Efficiënt en nauwkeurig

Twee studies online gepubliceerd, voorafgaand aan het aprilnummer van de American Journal of Obstetrics & Gynecology (AJOG), laten zien dat het risico van een foetus met chromosomale afwijkingen die het Down-syndroom veroorzaken, en een genetische aandoening die bekend staat als het syndroom van Edwards, nu bijna precies kan worden geïdentificeerd door een niet-invasieve test op maternaal bloed te gebruiken waarbij een nieuwe biochemische test en een nieuw algoritme zijn betrokken voor analyse.
Behalve dat deze test beter schaalbaar is, vergeleken met andere recent ontwikkelde genetische screeningtests, kan deze test ook onnodige vruchtwaterpunctie of CVS verminderen.
Het diagnosticeren van foetale chromosomale afwijkingen, of aneuploidieën, vereist invasieve tests die bestaan ??uit chorionic villous sampling of vruchtwaterpunctie bij zwangerschappen waarvan bekend is dat ze een hoog risico vormen, en hoewel deze tests accuraat zijn, zijn ze kostbaar en lopen ze het risico van een miskraam.
Massaal parallel shotgunsequencing (MPSS), een techniek die celvrij DNA (cfDNA) onderzoekt uit het moeders plasma voor foetale omstandigheden, is gebruikt om trisomie 21 (T21) zwangerschappen te identificeren, dat wil zeggen zwangerschappen met een extra kopie van chromosoom 21, wat leidt tot naar Down-syndroom en trisomie 18 (T18), het chromosomale defect dat ten grondslag ligt aan het Edwards-syndroom. Hoewel MPSS deze aandoeningen nauwkeurig kan detecteren door het hele genoom te analyseren, vereist dit DNA-sequencing van grote hoeveelheden en daarom is de klinische bruikbaarheid beperkt.
Een nieuwe test, Digital Analysis of Selected Regions (DANSR ™) genaamd, is onlangs ontwikkeld door wetenschappers van Aria Diagnostics in San Jose, Californië, die loci sequencen van alleen die chromosomen die worden onderzocht, wat 10 keer minder DNA-sequencing vereist in vergelijking met MPSS.
De huidige studie beschrijft een nieuw statistisch algoritme, het foetale fractie-geoptimaliseerde risico op trisomie-evaluatie (FORTE ™), waarbij rekening wordt gehouden met leeftijdgerelateerde risico's en het percentage foetaal DNA in de steekproef om een ??geïndividualiseerde risicoscore te bieden voor trisomie. Hoofdonderzoeker Dr. Ken Song, MD, legt uit:

"Hoe hoger de fractie van foetale cfDNA, hoe groter het verschil in het aantal cfDNA-fragmenten afkomstig van trisomische versus disomische [normale] chromosomen en dus hoe gemakkelijker het is om trisomie te detecteren.Het FORTE-algoritme verklaart expliciet de foetale fractie bij het berekenen van het trisomarisico ."

Dr. Song en zijn team trachten 123 normale zwangerschappen, 36 T21 en 8 T18 zwangerschappen te beoordelen om de prestaties van de DANSR / FORTE-test te beoordelen. Ze verwezen alle monsters voor FORTE oneven scores van chromosoom 18 en chromosoom 21 en ontdekten in een geblindeerde analyse dat de combinatie van DANSR en FORTE erin slaagde om alle 36 gevallen van T21 en 8 gevallen van T18 correct te identificeren als met een risico van meer dan 99% voor elke trisomie. De scheidingen in risicoscore tussen trisomische en disomische monsters waren ten minste een factor 1000 groter.
In een bijbehorende studie verschaften onderzoekers van het Harris Birthright Research Center voor Foetale Geneeskunde in het Kings College Hospital in Londen en het University College London Hospital 400 maternale plasmamonsters aan Aria voor een DANSR-analyse met het FORTE-algoritme. Alle proefpersonen liepen risico op aneuploïdieën en waren getest met chorionic villous sampling.
Volgens de analyseresultaten werden alle gevallen van T21 en 98% van de T18-gevallen van euploïde zwangerschappen geïdentificeerd, wat aantoont dat alle gevallen van T21 een geschat risico hadden voor deze aneuploïdie van ? 99%, terwijl alle normale zwangerschappen en die met T18 een risicoscore voor T21 van ? 0,01%.
Dr. Song legt uit:

"Het combineren van de DANSR-test met het FORTE-algoritme biedt een robuuste en nauwkeurige beoordeling van foetale trisomyrisico's Omdat DANSR analyse van specifieke genomische regio's mogelijk maakt, zou het potentieel kunnen worden gebruikt om andere genetische condities dan trisomie te evalueren. vanaf echografie, in het FORTE-algoritme is onderzoek gerechtvaardigd. "

Hoofdonderzoeker Kypros H. Nicolaides, MD, van de studie van de Universiteit van Londen gelooft dat foetale trisomie-evaluatie met cfDNA-testen vroeg of laat in de klinische praktijk zal worden geïntroduceerd, zeggende:

"Het zou nuttig zijn als een secundaire test afhankelijk is van de resultaten van een meer universeel toepasbare primaire screeningsmethode. De mate waarin deze zou kunnen worden toegepast als een universeel screeningsinstrument hangt af van het feit of de kosten vergelijkbaar worden met die van de huidige methoden voor echografie. en biochemische testen. "

Dr. Nicolaides benadrukt dat de plasmamonsters zijn genomen van risicovolle zwangerschappen die enig bewijs van een verminderde placenta-functie vertoonden, en voegt eraan toe dat het verdere tests vereist om te bevestigen dat de waargenomen nauwkeurigheid met cfDNA-testen van het onderzoek naar zwangerschappen met een hoog risico voor aneuploidieën geldt ook voor de algemene populatie, waarin de prevalentie van foetale trisomie 21 aanzienlijk lager is.
Hij concludeert:

"Dit kan heel goed het geval zijn, omdat het vermogen om aneuploïdie met cfDNA te detecteren, afhankelijk is van testprecisie en foetaal DNA-percentage in het monster in plaats van de prevalentie van de ziekte in de studiepopulatie."

Geschreven door Petra Rattue